El GI-MAP® incluye patógenos (bacterianos, parasitarios y virales) comúnmente conocidos por causar gastroenteritis intestinal. Es importante tener en cuenta que no todas las personas con hallazgos positivos para patógenos presentarán síntomas. Muchos factores, incluida la salud del individuo, la naturaleza transitoria de algunos patógenos y la presencia y expresión de factores de virulencia contribuyen a los síntomas de un individuo.

Las toxinas son un tipo de factor de virulencia producido por ciertos patógenos. Dado que GI-MAP es una prueba basada en ADN, los resultados reflejan los niveles de cepas patógenas que portan los genes de la toxina, no los niveles de cualquier toxina que pueda producirse.